南方科技大学稳步推进各类科研平台建设，截至2024年底，在自然科学类平台建设方面，获批建设4个国家级科研平台、45个省部级科研平台、72个市级科研平台，其中包括1个全国重点实验室、1个国家应用数学中心、1个国家野外科学观测研究站、1个生态环境部重点实验室、1个教育部工程研究中心、1个教育部重点实验室、1个广东省基础学科研究中心、3个粤港澳联合实验室、14个广东省重点实验室、1个广东省野外科学观测研究站、1个广东省高等学校基础研究卓越中心、12个广东省普通高校重点实验室、2个粤港澳高校联合实验室、2个广东省工程研究中心、1个广东省中试平台、4个广东省工程技术研究中心、1个广东省实验室深圳分部、、3个深圳市诺奖实验室、45个深圳市重点实验室、6个深圳市工程实验室、2个市公共服务平台、9个深圳市工程研究中心、1个十大基础研究机构、1个市级重大科技基础设施、1个产业链协同创新公共服务平台、1个深圳市概念验证中心、1个深圳市创新创业基地，2个南山区创新机构；在人文社科平台建设方面，获批建设10个省部级平台，6个市级平台，包括1个广东省哲学社会科学重点实验室、3个广东省社会科学研究基地、2个广东省决策咨询研究基地、1个广东省普通高校哲学社会科学重点实验室、1个广东省普通高校特色新型智库、6个市级文科重点研究基地，以及2个广东省人文社科普及基地。