师资
个人简介:
车骏,副研究员,医学院研究序列副教授。于2015年博士毕业于美国德州大学健康科学中心。2015-2020年在美国德州大学健康科学中心做博士后及副研究员。专注于DNA损伤修复,DNA重组和DNA损伤耐受的基础生物学研究。目前已在Nature Structural & molecular biology, The EMBO Journal, PLoS Genetics, Microbial Cell 等杂志发表文章8篇。
研究领域
1 DNA损伤耐受的生物学机制
2 DNA损伤修复和损伤耐受的表观遗传学
教育背景:
2008-2015 理学博士 遗传学 德州大学健康科学中心 美国
2004-2007 硕士 细胞遗传学 中国科学院昆明动物研究所
2000-2004工学学士 生物工程 西安交通大学
工作经历:
12/2020-至今 研究序列副教授,南方科技大学
08/2015 -10/2020 博士后及副研究员,德州大学健康科学中心 美国
01/2008-07/2008 项目负责人,北京华大基因
获奖情况及荣誉:
德州CPRIT 博士生奖学金 2011,2012
研究领域:
DNA损伤耐受
从原核到真核,每一个细胞、每一天都会发生大量的不同类别的DNA损伤 (每10kb DNA约1个DNA损伤)。虽然大部分损伤可以被不同的DNA损伤修复通路清除掉,没有被修复的DNA损伤会严重影响依赖于DNA模板的生物学过程,比如DNA复制和转录。当DNA复制开始后,细胞有一种机制使得复制叉可以暂时越过这些DNA损伤,而不是修复它们,从而确保DNA复制的完成。这一机制被称为DNA损伤耐受(DNA damage tolerance,DDT)。它是基因突变和染色体发生重排最重要的原因。因此与癌症,衰老,耐药的产生等多种疾病有着密切的关系。
DDT包含跨越损伤合成(Transleion synthesis,TLS)和模板切换(template switching,TS)两条通路。尽管该机制已被研究了近半个世纪,仍然有许多重要的问题没有被解答。比如,TLS和TS两条通路是如何被细胞选择的?DDT具体在什么时间发生,是在复制叉受阻停滞的地方,还是复制叉通过以后?两条通路涉及到一个最为重要的分子及修饰是PCNA K164的单泛素化和多聚泛素化(K63-linkaged),虽然介导他的酶发现已久,但是人们对于PCNAK164多聚泛素化如何促进模板切换(TS)通路却仍然未知。
我们使用模式生物酿酒酵母在这一领域深耕多年,目前已经取得了重要的进展。我们开发出一系列独特的遗传学和分子生物学方法并发现了新的分子和调节机制,这将为回答上述难题奠定重要的基础。
发表论文:
1 Li X, McConnell K, Che J, Ha C, Lee SE, Kirby N, Shim EY. DNA Dosimeter Measurement of Relative Biological Effectiveness for 160 kVp and 6 MV X Rays. Radiat Res 2020 Aug 1;194(2):173-179.
2 Lee K, Ji JH, Yoon K, Che J, Seol JH, Lee SE, Shim EY. Microhomology Selection for Microhomology Mediated End Joining in Saccharomyces cerevisiae. Genes (Basel). 2019 Apr 8;10(4).
3 Li F, Wang Q, Seol JH, Che J, Lu X, Shim EY, Lee SE, Niu H. Apn2 resolves blocked 3' ends and suppresses Top1-induced mutagenesis at genomic rNMP sites. Nat Struct Mol Biol. 2019 Mar; 26 (3):155-163.
4 Klein HL, Bačinskaja G, Che J, Cheblal A, et al, Guidelines for DNA recombination and repair studies: Cellular assays of DNA repair pathways. Microb Cell. 2019 Jan 7;6(1):1-64.
5 Jun Che, Stephanie Smith, Yoo Jung Kim, Eun Yong Shim, Kyungjae Myung & Sang Eun Lee. Hyper-acetylation of Histone H3 K56 limits break-induced replication by inhibiting extensive repair synthesis. PLoS Genetics 2015 Feb 23;11(2):e1004990.
6 Sung S, Li F, Park YB Kim JS, Kim AK, Song OK, Kim J, Che J, Lee SE, Cho Y. DNA end recognition by the Mre11 nuclease dimer: insights into resection and repair of damaged DNA EMBO J. 2014 Aug 8. pii: e201488299. [Epub ahead of print]
7 Niu AL, Wang YQ, Zhang H, Liao CH, Wang JK, Zhang R, Che J, Su B. Rapid evolution and copy number variation of primate RHOXF2, an X-linked homeobox gene involved in male reproduction and possibly brain function. BMC Evolutionary Biology 2011, 11:298
8 Che J, Wang J, Su W, Ye J, Wang Y, Nie W, Yang F, Construction, characterization and FISH mapping of a bacterial artificial chromosome library of Chinese pangolin (Manis pentadactyla). Cytogenet Genome Res, 2008. 122(1): p. 55-60.